Медицина факультеті:

• Ішкі аурулар пропедевтикасы кафедрасы;

• Биология және биохимия кафедрасы;

• Микробиология вирусология және иммунология кафедрасы;

• Неврология, психиатрия және психология кафедрасы;

• Қазақстан тарихы және әлеуметтік-қоғамдық пәндер кафедрасы;

• Қалыпты және патологиялық физиология кафедрасы;

• Дене шынықтыру кафедрасы;

• Қалыпты анатомия кафедрасы;

• Патологиялық анатомия және гистология кафедрасы;

• Гигиена және эпидемиология кафедрасы;

• Әлеуметтік медициналық сақтандыру және қоғам денсаулығы кафедрасы;

• Жедел медициналық жәрдем және мейіргер ісі кафедрасы;

• Стоматологиялық пәндер кафедрасы; 

• Педиатрия-2 кафедрасы.

Фармацевтика факультеті: 

• Химиялық пәндер кафедрасы;

• Фармакогнозия кафедрасы;

• Қазақ, орыс және латын тілдері кафедрасы;

• Шет тілдері кафедрасы;

• Әлеуметтік-гуманитарлық пәндер кафедрасы;

• Медициналық биофизика және ақпараттық технологиялар кафедрасы;

• Фармакология, фармакотерапия және клиникалық фармакология кафедрасы;

• Фармацевтикалық және токсикологиялық химия кафедрасы;

• Фармация ісін ұйымдастыру және басқару кафедрасы;

• Дәрілер технологиясы кафедрасы; 

• Фармацевтикалық өндіріс технологиясы.

Интернатура: 

• Хирургиялық пәндер кафедрасы;

• Хирургия-2 кафедрасы;

• Терапиялық пәндер кафедрасы;

• Педиатрия және балалар хирургиясы кафедрасы;

• Жұқпалы аурулар және дерматовенерология кафедрасы;

• «Жалпы тәжірибелік дәрігер – 1» кафедрасы;

• «Жалпы тәжірибелік дәрігер – 2» кафедрасы;

• Акушерлік және гинекология кафедрасы.

Медициналық колледж кафедралары

• Клиникалық пәндер кафедрасы

• Мейіргер ісі кафедрасы

• Жалпы білім беретін пәндер кафедрасы

 Резидентура бөлімі

• Отбасылық медицина кафедрасы