Медицина факультеті:
• Ішкі аурулар пропедевтикасы кафедрасы;
• Биология және биохимия кафедрасы;
• Микробиология вирусология және иммунология кафедрасы;
• Неврология, психиатрия және психология кафедрасы;
• Қазақстан тарихы және әлеуметтік-қоғамдық пәндер кафедрасы;
• Қалыпты және патологиялық физиология кафедрасы;
• Патологиялық анатомия және гистология кафедрасы;
• Гигиена және эпидемиология кафедрасы;
• Әлеуметтік медициналық сақтандыру және қоғам денсаулығы кафедрасы;
• Жедел медициналық жәрдем және мейіргер ісі кафедрасы;
• Стоматологиялық пәндер кафедрасы;
Фармацевтика факультеті:
• Қазақ, орыс және латын тілдері кафедрасы;
• Әлеуметтік-гуманитарлық пәндер кафедрасы;
• Медициналық биофизика және ақпараттық технологиялар кафедрасы;
• Фармакология, фармакотерапия және клиникалық фармакология кафедрасы;
• Фармацевтикалық және токсикологиялық химия кафедрасы;
• Фармация ісін ұйымдастыру және басқару кафедрасы;
• Дәрілер технологиясы кафедрасы;
• Фармацевтикалық өндіріс технологиясы.
Интернатура:
• Хирургиялық пәндер кафедрасы;
• Терапиялық пәндер кафедрасы;
• Педиатрия және балалар хирургиясы кафедрасы;
• Жұқпалы аурулар және дерматовенерология кафедрасы;
• «Жалпы тәжірибелік дәрігер – 1» кафедрасы;
• «Жалпы тәжірибелік дәрігер – 2» кафедрасы;
• Акушерлік және гинекология кафедрасы.
Әскери кафедра